原创:QIAGEN/凯杰生命科学

众所周知，通过对癌症患者血浆中提取出来的ccfDNA的分析，可以为肿瘤特异性遗传和表观遗传性改变提供全面且独到的见解，从而帮助医生更早发现、监测癌症，以及更有效地治疗癌症患者。比如，ctDNA可用于检测乳腺癌患者术后检测肿瘤细胞是否发生转移，与此同时，乳腺癌患者血浆中总游离线粒体DNA（mtDNA）的水平可跟预后的组织学分级、肿瘤分期等参数有关，这也表明mtDNA新型标志物具备一定的诊断应用前景。

对于上述应用而言，灵活且自动化的获得高品质的ccfDNA已经成为必需。与经典的硅胶膜手工纯化方法相比，磁珠法具有硅胶膜离心柱法无法比拟的优势：磁珠结合核酸的表面积更大，更利于ccfDNA等纯化；自动化程度更高、操作简便快速、封闭体系更安全，适合临床样本应用。市面上基于磁珠纯化的方案千千万，小编结合以下应用案例，带您更深入了解自动化磁珠法方案是如何加入乳腺癌研究的进程。

本案例中[1]，德国埃尔兰根大学医院综合癌症中心妇产科的研究人员对比了基于磁珠法纯化核酸的两种不同的自动化核酸提取平台，并对ccfDNA的提取用时、产量等进行了对比分析。

研究人员选取30位乳腺癌患者（组织学检查已确诊），分别进行采血以及ccfDNA的提取，最后利用不同检测平台对ccfDNA提取的产量进行检测。

结果表明采用QIAGEN的EZ2 Connect的EZ2 ccfDNA kit仅需66分钟即可轻松完成16个样本的纯化，比Competitor P的Maxwell快了近20%。接着采用三种不同检测平台对总DNA进行定量的结果均显示，EZ2 Connect所得的DNA产量显著高于Maxwell (Fig.1a）；两种核酸提取平台所得核酸浓度均呈关联性(Fig.1b-d)；EZ2 Connect 所得的ccfDNA产量也是高于Maxwell (Fig.1e)；此外，利用qPCR平台检测所提取的游离mtDNA的产量更是明显高于Maxwell，大概高出15.9倍 (Fig. 1f)。EZ2 Connect还提供更大体积的样本处理量[2]，研究者对比2ml、4ml以及8ml的处理量可以得到产量依次增加的ccfDNA (Fig.1g)，并且EZ2 Connect的通量更高，处理的体积范围更广更大，这无疑将会给工作人员带来更大的灵活选择性。

QIAGEN的EZ2 Connect全自动核酸提取仪机内配备加热裂解模块可直接对样本进行机内裂解，采用预装试剂盒、最大程度防止交叉污染的发生。可灵活处理1-24个不同来源的样本，高达8ml的处理体积能极度契合液体活检应用，确保获取高产量、高灵敏度的结果。此外，还提供多款配套试剂盒完成对血液、FFPE等样本的核酸提取，其中带有UNG酶的EZ1＆2 DNA FFPE(UNG) kit可去除假阳性从而获取更准确的结果。EZ2 Connect具备第一类医疗器械备案并已实现本土化（货号9003210-CN，粤深械备 20221081），从而更完美地实现国内客户对高速度、高产量、高标准ccfDNA纯化的需求。

参考文献：

1.Evaluation of automated techniques for extraction of circulating cell-free DNA for implementation in standardized high-throughput workflows. Sarah Lehle, Julius Emons, Carolin C. Hack, Felix Heindl, Alexander Hein, Caroline Preuß, Katharina Seitz, Anna L. Zahn, Matthias W. Beckmann, Peter A. Fasching, Matthias Ruebner＆ Hanna Huebner.(2023)

2.Processing of large-volume liquid biopsyies: cfDNA isolation and CTC enrichment with subsequent mRNA isolation. Simon Hertlein, Eva Haenssler, Stefan Hey, Michael Otte, Siegfried Hauch and Martin Schlumpberger QIAGEN Strasse 1, 40724 Hilden, Germany.(2022)

QIAGEN/凯杰是全球领先的样本制备和分析技术供应商。凭借全球领先的技术和专业知识不断拓展从样本制备,分析到数据解读的市场。在学术研究、应用检测、生物医药和分子诊断领域的研究和检测过程中,全球超过50万客户选择了QIAGEN。

QIAGEN/凯杰产品包括:DNA和RNA提取,质粒DNA提取,微生物核酸样本制备,液体活检,重点PCR和定量PCR,表观遗传,NGS文库构建,蛋白提取,单细胞核酸样本制备,分析软件和数据库等。